L'Area B si trova nella zona settentrionale di Tell Afis. Nel 1999 fu aperta una lunga trincea (20x5 m), ampliata nel 2000 e nel 2001, che portò alla luce tratti consistenti delle mura urbiche, di una porta e di edifici dell'Età del Ferro II e delle mura del Bronzo Medio I-II. Nell'area B1 le mura del Bronzo Medio, esposte per una lunghezza di 30 m e uno spessore di 8 m, erano conservate fino ad un'altezza di circa 2 m. Costruite sul suolo vergine, erano costituite da una doppia cortina: quella interna presenta fondazioni in pietrame di dimensioni medie e grandi, con soprastruttura in mattone crudo, mentre quella esterna è costituita soltanto da mattoni crudi. All'esterno delle mura, a un livello inferiore, si trovavano anche alcune sepolture con corredi ceramici e una figurina femminile nuda con orecchini in argento. Sopra queste mura nel Ferro II fu costruito un edificio che ha restituito bella ceramica, poi distrutto e sigillato nel Ferro III dalle mura della città di questa fase (area B2). Spesse fino a 5.4 m, costruite interamente in mattoni crudi, queste mura sono state portate alla luce per una lunghezza di 15 metri. Verso est, due strutture contrapposte, in mattoni crudi su fondazioni in pietra, potrebbero essere identificate come i contrafforti esterni della porta urbica del Ferro II-III. A nord delle mura (area B3), gli scavi hanno esplorato i resti di un’abitazione con piccoli vani, che potrebbe essere parte della casa individuata nell’Area B2. A est si apriva una corte in cui si trovavano un silo e una banchina quadrangolare di mattoni, parte di un’installazione tessile (probabilmente un telaio verticale), identificabile per la presenza di numerosi pesi da telaio. A sud delle mura correva una strada che delimitata un quartiere di abitazioni.
